Το εργοστάσιο της Bayer Ελλάς στο `Υπατο Θηβών εφαρμόζει σύστημα περιβαλλοντικής διαχείρισης, το οποίο είναι πιστοποιημένο σύμφωνα με το πρότυπο ISO 14001 από το 1999. Πέρα όμως από την πιστοποίηση, η εφαρμογή των αρχών της Υπεύθυνης Φροντίδας και του Συστήματος Περιβαλλοντικής Διαχείρισης, με στόχο την συνεχή βελτίωση των μέτρων προστασίας του περιβάλλοντος, αποτελεί καθημερινή φροντίδα της Διοίκησης του Εργοστασίου και της εταιρείας.
Στο πλαίσιο αυτό η Bayer Ελλάς πραγματοποιεί περιοδικά μετρήσεις ελέγχου της αξιοπιστίας των συστημάτων προστασίας του περιβάλλοντος, που χρησιμοποιεί στο εργοστάσιό της.
Στις 9 Ιουλίου 2002, με δική της πρωτοβουλία, η εταιρεία Bayer σε συνεργασία με το Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο και την TUEV Ελλάς πραγματοποίησε μετρήσεις εκπομπής στην ατμόσφαιρα αιωρούμενων στερεών σωματιδίων, στις εγκαταστάσεις του εργοστασίου της.
Οι μετρήσεις πραγματοποιήθηκαν από το Εργαστήριο Ατμοκινητήρων και Λεβήτων του Τμήματος Μηχανολόγων Μηχανικών του ΕΜΠ, με ευθύνη του Δρ. Βουρλιώτη Παναγιώτη από το ΕΜΠ, υπό τον συντονισμό του Δρ. Αχλάδα Παναγιώτη από την TUEV.
Μετρήσεις πραγματοποιήθηκαν σε όλα τα τμήματα των βιομηχανικών εγκαταστάσεων που υπάρχουν απαγωγοί σκόνης και συγκεκριμένα:
1. στην καμινάδα του αποτεφρωτήρα
2. στον απαγωγό σκόνης στο τμήμα συσκευασίας στερεών ζιζανιοκτόνων
3. στο σύνολο των απαγωγών σκόνης (7) στο τμήμα συσκευασίας στερεών προϊόντων
Από την επεξεργασία των μετρήσεων προέκυψε, ότι οι τιμές για τη μέση συγκέντρωση στερεών σωματιδίων στα παραπάνω σημεία είναι σημαντικά μικρότερες από την οριακή τιμή εκπομπής των 100 mg/Nm3 που ορίζει η νομοθεσία Π.Δ. 1180/81 (ΦΕΚ 293Α/6/10/81) για τα στερεά εν αιωρήσει (σκόνη) που εκπέμπονται στην ατμόσφαιρα.
Τα αποτελέσματα των μετρήσεων επιβεβαιώνουν την άριστη λειτουργία των σύγχρονων συστημάτων προστασίας του περιβάλλοντος, που διαθέτει το εργοστάσιο. Επιπλέον αποδεικνύουν το συνεχές, έμπρακτο και αμείωτο ενδιαφέρον της Bayer για την προστασία του περιβάλλοντος, αφ'ενός μεν με την εγκατάσταση των πλέον σύγχρονων μονάδων αντιρρύπανσης, αφετέρου με την εξασφάλιση της άριστης λειτουργίας τους, χάρη στην συνεχή προσπάθεια όλων των συνεργατών του εργοστασίου. Η διεύθυνση της εταιρείας δεσμεύεται να συνεχίσει και στο μέλλον με παρόμοιες προσπάθειες.